BPRMeth

DOI:10.18129 / B9.bioc.BPRMeth

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BPRMeth。

模型高阶甲基化的概要文件

Bioconductor版本:3.11

BPRMeth包是一个概率的方法来量化明确的甲基化资料的特点,在某种程度上,这将使它更容易在下游正式使用这些资料建模,如预测基因表达水平或集群基因组区域或细胞根据其甲基化配置文件。

作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani (aut (cre)

维护人员:Chantriolnt-Andreas Kapourani < kapouranis。安德烈亚斯在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BPRMeth”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“BPRMeth”)

HTML	R脚本	BPRMeth:模型高阶甲基化的概要文件
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文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,聚类,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,ImmunoOncology,KEGG,RNASeq,回归,测序,SingleCell,软件
版本	1.14.1
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0),GenomicRanges
进口	为了、方法、质量,doParallel平行,e1071,地球,foreach,randomForest统计数据,IRanges,S4Vectors,data.table、图形、truncnorm,mvtnorm,Rcpp(> = 0.12.14),matrixcalc,magrittr,kernlab,ggplot2,cowplot,BiocStyle
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	梅丽莎
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BPRMeth_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	BPRMeth_1.14.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	BPRMeth_1.14.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BPRMeth
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/
包下载报告	下载数据