BBCAnalyzer

DOI:10.18129 / B9.bioc.BBCAnalyzer

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BBCAnalyzer

BBCAnalyzer: R / Bioconductor可视化方案的基础

Bioconductor版本:3.11

BBCAnalyzer是可视化的包数量相对或绝对的基地,删除和插入在职位序列比对数据定义为bam文件相比,参考基地。标记的相对基本频率,平均质量检测基地,已知的突变和多态性变异叫另外的数据可能被包括在情节。

作者:莎拉Sandmann

维修工:莎拉Sandmann <萨拉。在uni-muenster.de sandmann >

从内部引用(R,回车引用(“BBCAnalyzer”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BBCAnalyzer”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BBCAnalyzer”)

PDF R脚本 使用BBCAnalyzer
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,报道,GeneticVariability,单核苷酸多态性,测序,软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(5年)
许可证 LGPL-3
取决于
进口 SummarizedExperiment,VariantAnnotation,RsamtoolsgrDevices,GenomicRanges,IRanges,Biostrings
链接
建议 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 BBCAnalyzer_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 BBCAnalyzer_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉) BBCAnalyzer_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BBCAnalyzer
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BBCAnalyzer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BBCAnalyzer/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网