这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BBCAnalyzer。
Bioconductor版本:3.11
BBCAnalyzer是可视化的包数量相对或绝对的基地,删除和插入在职位序列比对数据定义为bam文件相比,参考基地。标记的相对基本频率,平均质量检测基地,已知的突变和多态性变异叫另外的数据可能被包括在情节。
作者:莎拉Sandmann
维修工:莎拉Sandmann <萨拉。在uni-muenster.de sandmann >
从内部引用(R,回车引用(“BBCAnalyzer”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BBCAnalyzer”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BBCAnalyzer”)
R脚本 | 使用BBCAnalyzer | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,报道,GeneticVariability,单核苷酸多态性,测序,软件 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | |
进口 | SummarizedExperiment,VariantAnnotation,RsamtoolsgrDevices,GenomicRanges,IRanges,Biostrings |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | BBCAnalyzer_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | BBCAnalyzer_1.18.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | BBCAnalyzer_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BBCAnalyzer |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BBCAnalyzer |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BBCAnalyzer/ |
包下载报告 | 下载数据 |