此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ArrayExpressHTS.
Bioconductor版本:3.11
用于公共ArrayExpress实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道
作者:Angela Goncalves, Andrew Tikhonov
维护者:Angela Goncalves
引文(从R内,输入引用(“ArrayExpressHTS”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ArrayExpressHTS”)
R脚本 | ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年) |
许可证 | 艺术许可2.0 |
取决于 | 抽样,Rsamtools(> = 1.99.0),雪 |
进口 | Biobase,BiocGenerics,Biostrings,DESeq,GenomicRanges,Hmisc,IRanges(> = 2.13.11),R2HTML,RColorBrewer,Rsamtools,ShortRead,XML,biomaRt,刨边机, grDevices,图形,方法,rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailR,bitops |
链接 | Rhtslib(> = 1.15.3) |
建议 | |
SystemRequirements | GNU使 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ArrayExpressHTS_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | ArrayExpressHTS_1.38.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpressHTS |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ArrayExpressHTS |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/ |
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