AnnotationHubdata

doi：10.18129/b9.bioc.annotationHubdata

此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅AnnotationHubdata。

将公共数据资源转换为生物导体数据结构

生物导体版本：3.11

这些食谱将各种各样的种类和越来越多的公共生物信息学数据集转化为易于使用的标准生物导体数据结构。

作者：Martin Morgan [CTB]，Marc Carlson [CTB]，Dan Tenenbaum [CTB]，Sonali Arora [CTB]，Paul Shannon [CTB] [CTB]，Lori Shepherd [CTB]，Bioconductuctor套件维护者[CRE] [CRE]

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ AnnotationHubdata”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ AnnotationHubdata”）

html		AnnotationHub：创建一个AnnotationHub软件包
html		AnnotationHubdata简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，软件
版本	1.18.1
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.2.2），方法，utils，S4VECTORS（> = 0.7.21），iranges（> = 2.3.23），基因组机，，，，AnnotationHub（> = 2.15.15）
进口	GenomicFeatures，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，生物基因，，，，jsonlite，，，，生物管理器，，，，生物浏览，，，，AnnotationDbi，，，，生物酶，，，，生物弦，，，，DBI，，，，GenomeInfodB（> = 1.15.4），有机体，，，，rsqlite，，，，rbiopaxparser，，，，注释，，，，徒劳（> = 1.3.0），XML，，，，rcurl
链接
建议	运行，，，，尼特，，，，生物使用，，，，grasp2db，，，，GenomeInfodBdata
系统要求
增强
URL
取决于我	实验室，，，，蛋白质组学杂志
进口我	Ahensdbs，，，，eupathdb
建议我	基因组态
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	AnnotationHubdata_1.18.1.tar.gz
Windows二进制	AnnotationHubdata_1.18.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	AnnotationHubdata_1.18.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotationHubdata
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/AnnotationHubdata
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/annotationhubdata/
软件包下载报告	下载统计