AffiXcan

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffiXcan

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AffiXcan。

功能的方法来嫁祸于基因调控表达

Bioconductor版本:3.11

归咎于GReX(基因调控表达)一组样品中基因的个体,使用一个方法基于总绑定关联(稍后通知)。统计模型推导出GReX可以训练一个训练数据集,真正的总表达式的值是已知的。

作者:亚历山德罗Lussana (aut (cre)

维护人员:亚历山德罗Lussana <亚历山德罗。在protonmail.com lussana >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AffiXcan”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	AffiXcan
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,GeneExpression,GeneRegulation,PrincipalComponent,回归,软件,转录
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6),SummarizedExperiment
进口	MultiAssayExperiment,BiocParallel,