ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ASpli

分析使用RNA-Seq可变剪接

Bioconductor版本:3.11

综合管线的分析使用RNAseq可变剪接。

作者:给曼奇尼,Andres拉比诺维奇,哈维尔Iserte,马塞洛Yanovsky和爱丽儿Chernomoretz

维护人员:给曼奇尼< emancini在leloir.org.ar >

从内部引用(R,回车引用(“ASpli”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ASpli”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ASpli”)

PDF R脚本 分析使用ASpli可变剪接
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文本 新闻

细节

biocViews 对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录
版本 1.14.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(4年)
许可证 GPL
取决于 方法、grDevices统计,跑龙套,平行,刨边机
进口 GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,AnnotationDbi,Rsamtools,BiocStyle
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ASpli_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 ASpli_1.14.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ASpli_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ASpli
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
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