- 家
- Bioconductor 3.11
- 软件包
- ASpli
ASpli
DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ASpli。
分析使用RNA-Seq可变剪接
Bioconductor版本:3.11
综合管线的分析使用RNAseq可变剪接。
作者:给曼奇尼,Andres拉比诺维奇,哈维尔Iserte,马塞洛Yanovsky和爱丽儿Chernomoretz
维护人员:给曼奇尼< emancini在leloir.org.ar >
从内部引用(R,回车引用(“ASpli”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ASpli”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ASpli”)
| R脚本 | 分析使用ASpli可变剪接 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录 |
| 版本 | 1.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(4年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | 方法、grDevices统计,跑龙套,平行,刨边机 |
| 进口 | GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocGenerics,IRanges,GenomicAlignments,Gviz,S4Vectors,AnnotationDbi,Rsamtools,BiocStyle |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ASpli_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ASpli_1.14.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | ASpli_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ASpli |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
