ASpediaFI

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpediaFI

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ASpediaFI。

ASpedia-FI:功能交互分析可变剪接事件

Bioconductor版本:3.11

这个包提供了系统的功能,并综合分析可变剪接事件和其功能的交互。

作者:Doyeong Yu Kyubin Lee Daejin Hyung,秀年轻赵Charny公园

维护人员:Doyeong Yu < parklab。bi: gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ASpediaFI”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ASpediaFI”)

PDF	R脚本	ASpediaFI.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,注释,报道,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,KEGG,网络,NetworkInference,通路,Reactome,测序,软件,转录,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0),SummarizedExperiment,ROCR
进口	BiocParallel,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,iva,Rsamtools,biomaRt,limma,S4Vectors统计数据,DRaWR,GenomeInfoDb,Gviz,矩阵,dplyr,fgsea,reshape2,igraph、图形、e1071、方法、rtracklayer,尺度、网格ggplot2,mGSZ,跑龙套
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/nachoryu/ASpediaFI
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ASpediaFI_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ASpediaFI_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ASpediaFI_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpediaFI
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ASpediaFI
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ASpediaFI/
包下载报告	下载数据