蛋白质组学

DOI:10.18129 / B9.bioc.proteomics

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅蛋白质组学

质谱和蛋白质组学数据分析

Bioconductor版本:3.10

这个工作流程说明了R / Bioconductor蛋白质组学的基础设施。主题集中在支持开放社区驱动的格式的原始数据和识别结果,包peptide-spectrum匹配、数据处理和分析。

作者:洛朗与(aut (cre)

维修工:Laurent与<劳伦。与在uclouvain.be >

从内部引用(R,回车引用(“蛋白质组学”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“蛋白质组学”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“蛋白质组学”)

HTML R脚本 R / Bioc蛋白质组学工作流

细节

biocViews ImmunoOncologyWorkflow,ProteomicsWorkflow,工作流
版本 1.10.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3.0),mzR,mzID,MSnID,MSnbase,rpx,MLInterfaces,pRoloc,pRolocdata,MSGFplus,的方式,hpar
进口
链接
建议 knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/proteomics/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 proteomics_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteomics
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/蛋白质组学
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/proteomics/
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