eQTL

DOI:10.18129 / B9.bioc.eQTL

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见eQTL．

使用Bioconductor GGtools 5.x支持云计算的顺式eqtl搜索

Bioconductor版本:3.10

该工作流程的重点是在顺式中搜索eQTL，以便检测基因表达的本地DNA变体的相关性。

作者:文森特·凯里[aut, cre]

维护者:Vincent Carey

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("eQTL")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“eQTL”)

超文本标记语言

R脚本

使用Bioconductor GGtools 5.x支持云计算的顺式eqtl搜索

细节

biocViews	GenomicVariantsWorkflow，工作流
版本	1.10.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，GGdata，GGtools，GenomeInfoDb，S4Vectors，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，助理，biglm，data.table，doParallel，foreach，knitcitations，光民，lumiHumanAll.db平行,rmeta，scatterplot3d，snpStats、网格yri1kgv
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/help/workflows/eQTL/
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	eQTL_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eQTL
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/eQTL
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/eQTL/
软件包下载报告	下载数据