注释
DOI:10.18129 / B9.bioc.annotation
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见注释．
基因组注释资源
Bioconductor版本:3.10
注释资源在Bioconductor项目中占很大比例。此外，还有各种各样的在线资源可供使用，这些资源可以使用特定的软件包访问。本演练将描述这些资源中最流行的，并给出一些关于如何使用它们的高级示例。
作者:Marc RJ Carlson [aut]， Herve Pages [aut]， Sonali Arora [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Martin Morgan [aut]， Bioconductor Package Maintainer [cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内，输入引用(“注释”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("annotation")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“注释”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 注释基因组范围 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 基因组注释资源 |
细节
| biocViews | AnnotationWorkflow，工作流 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.3.0)，VariantAnnotation，AnnotationHub，Organism.dplyr，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，Homo.sapiens，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，biomaRt，BSgenome，TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/annotation/Annotation_Resources/ |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | annotation_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotation |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/annotation |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/annotation/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
