RNAseq123

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseq123

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAseq123．

使用limma, Glimma和edgeR, RNA-seq分析像1-2-3一样简单

Bioconductor版本:3.10

R包，支持f1000研究工作流文章，使用limma, Glimma和edgeR由Law等人(2016)进行RNA-seq分析。

作者:《慈善法》，Monther Alhamdoosh，苏珊安，董学义，田鲁一，Gordon Smyth, Matthew Ritchie

维护者:Matthew Ritchie

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAseq123")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAseq123”)

超文本标记语言	R脚本	用limma, Glimma和edgeR进行rna seq分析简单如1-2-3(中文版)
超文本标记语言	R脚本	使用limma, Glimma和edgeR, rna seq分析简单如1-2-3(英文版)

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow，ImmunoOncologyWorkflow，工作流
版本	1.10.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，Glimma(> = 1.1.9),limma，刨边机，gplots，RColorBrewer，Mus.musculus
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://f1000research.com/articles/5-1408/v3
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RNAseq123_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseq123
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAseq123
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseq123/
软件包下载报告	下载数据