ExpressionNormalizationWorkflow

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExpressionNormalizationWorkflow

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ExpressionNormalizationWorkflow。

基因表达的标准化工作流程

Bioconductor版本:3.10

一个广泛的,自定义表情规范化工作流程整合监督Microarryas正常化(核),代理变量方差分析(上海广电)和主成分分析来识别表达数据的批处理效果和删除它们提高能力来检测潜在的生物信号。

作者:Karthikeyan Murugesan (aut (cre),格雷格•吉布森(悲伤,黑色)

维护人员:Karthikeyan Murugesan < karthikeyanm60 yahoo.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ExpressionNormalizationWorkflow”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ExpressionNormalizationWorkflow”)

HTML

R脚本

基因表达的标准化工作流程

细节

biocViews	GeneExpressionWorkflow,ImmunoOncologyWorkflow,工作流
版本	1.12.0
许可证	GPL (> = 3)
取决于
进口	Biobase(> = 2.24.0),limma(> = 3.20.9),lme4(> = 1.1.7),matrixStats(> = 0.10.3),pvca(> = 1.4.0),球形结构(> = 1.12.0),股东价值分析(> = 3.10.0),vsn(> = 3.32.0)
链接
建议	knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ExpressionNormalizationWorkflow_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionNormalizationWorkflow
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExpressionNormalizationWorkflow
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ExpressionNormalizationWorkflow/
包下载报告	下载数据