Bioconductor工作流包

Bioconductor版本:3.10

维护人员 标题
注释 Bioconductor包维护者 基因组注释资源
数组 Bioconductor包维护者 使用生物导体进行微阵列分析
BgeeCall 朱利安Wollbrett RNA-Seq存在/缺失基因的自动表达称为生成
BiocMetaWorkflow 迈克•史密斯 关于发布一个BioC工作流
CAGEWorkflow 马尔特Thodberg 使用R/Bioconductor分析CAGE数据的逐步指南
chipseqDB 亚伦Lun Bioconductor工作流检测芯片序列数据中的差异绑定
csawUsersGuide 亚伦Lun csaw用户指南
cytofWorkflow 马格达雷娜Nowicka CyTOF工作流程:高通量高维细胞术数据集的差异发现
EGSEA123 马修·里奇 简单高效的EGSEA集成基因集检测
eQTL 文森特·凯里 Bioconductor GGtools 5.x支持云计算的cis-eQTL搜索
ExpressionNormalizationWorkflow Karthikeyan Murugesan 基因表达规范化工作流程
generegulation Bioconductor包维护者 通过序列匹配寻找已知转录因子的候选结合位点
highthroughputassays Bioconductor包维护者 利用生物导体进行高通量测定
liftOver Bioconductor包维护者 使用rtracklayer::liftOver改变基因组坐标系统
maEndToEnd 斯蒂芬妮Reisenauer 使用Affymetrix微阵列进行差异基因表达的端到端工作流
methylationArrayAnalysis Jovana Maksimovic 用于分析甲基化阵列数据的跨包Bioconductor工作流。
蛋白质组学 劳伦特与 质谱和蛋白质组学数据分析
recountWorkflow 莱昂纳多Collado-Torres 叙述工作流程:使用Bioconductor访问超过70,000人RNA-seq样本
RNAseq123 马修·里奇 rna序列分析简单如1-2-3 limma, Glimma和edgeR
rnaseqDTU 迈克尔的爱 Salmon量化后差异转录本使用的RNA-seq工作流程
rnaseqGene 迈克尔的爱 RNA-seq工作流程:基因级探索性分析和差异表达
RnaSeqGeneEdgeRQL Yunshun陈 使用Rsubread和edgeR准似然管道进行基因级RNA-seq差异表达和通路分析
测序 Bioconductor包维护者 序列数据生物导体简介
simpleSingleCell 亚伦Lun 使用Bioconductor对单细胞RNA-seq数据进行低级分析的逐步工作流程
SingscoreAMLMutations Dharmesh d Bhuva 使用singscore从转录组特征预测AML突变
TCGAWorkflow 蒂亚戈Chedraoui席尔瓦 使用Bioconductor软件包分析癌症基因组学和表观基因组学数据
变体 Bioconductor包维护者 注释的基因变异

»

Bioconductor的稳定,每半年发布:

Bioconductor也可通过码头工人而且Amazon Machine Images

开发版»

正在开发的生物导体包:

开发人员资源: