snpStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.snpStats

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅snpStats。

SnpMatrix XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:3.10

类和统计方法对大型SNP研究协会。这扩展了早些时候snpMatrix包,允许基因型的不确定性。

作者:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >

维修工:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“snpStats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“snpStats”)

PDF	R脚本	数据输入
PDF	R脚本	置
PDF	R脚本	归责和荟萃分析
PDF	R脚本	LD统计
PDF	R脚本	主成分分析
PDF		snpMatrix-differences
PDF	R脚本	snpStats介绍
PDF	R脚本	TDT)测试
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(9年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0),生存,矩阵、方法
进口	图形、grDevices统计,跑龙套,BiocGenerics,zlibbioc
链接
建议	hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	eQTL,GGBase,GGdata
进口我	FunciSNP,GeneGeneInteR,GGtools,gQTLstats,ldblock,马提尼,旅游房车,scoreInvHap
建议我	crlmm,gwascat,GWASTools,omicRexposome,omicsPrint,VariantAnnotation
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	snpStats_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	snpStats_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpStats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ snpStats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/
包下载报告	下载数据