tximportData

DOI:10.18129 / B9.bioc.tximportData

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见tximportData．

tximportData

Bioconductor版本:3.10

该包提供了在GEUVADIS项目的一组6个RNA-seq样本上运行各种转录丰度量化器的输出。量词分别是Cufflinks, RSEM, kallisto, Salmon和Sailfish。有关版本号、示例信息和调用细节的详细信息，请参阅包附页。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:Michael Love

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tximportData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tximportData”)

超文本标记语言	R脚本	tximport的示例输出文件
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，RNASeqData，SequencingData
版本	1.14.0
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	KnowSeq
建议我	DESeq2，HumanTranscriptomeCompendium，tximeta，tximport，variancePartition
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tximportData_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tximportData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tximportData/
软件包下载报告	下载数据