tcgaWGBSData.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.tcgaWGBSData.hg19

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tcgaWGBSData.hg19

数据

Bioconductor版本:3.10

TCGA中WGBS数据的数据包。数据以“总结实验格式”存储。关于如何提取数据和执行差异甲基化分析,请参阅小插图。

作者:Divy Kangeyan

维护者:Divy Kangeyan

引文(从R内,输入引用(“tcgaWGBSData.hg19”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tcgaWGBSData.hg19")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“tcgaWGBSData.hg19”)

超文本标记语言 R脚本 装饰图案的标题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CancerDataExperimentData基因组Homo_sapiens_DataSequencingData
版本 1.4.0
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.5.0),ExperimentHub
进口 bsseqknitr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/aryeelab/tcgaWGBSData.hg19/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 tcgaWGBSData.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcgaWGBSData.hg19
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tcgaWGBSData.hg19
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tcgaWGBSData.hg19/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网