此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅scrnaseq。
生物导体版本:3.10
基因级计数用于集合的公共SCRNA-seq数据集,该数据集以细胞和基因级元数据为单一的对象提供。
作者:Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Michael Cole [AUT],Aaron Lun [CTB]
维护者:davide risso
引用(从r内,输入引用(“ scrnaseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scrnaseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ scrnaseq”)
html | R脚本 | 用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据,,,,Singlecelldata |
版本 | 2.0.2 |
执照 | CC0 |
依靠 | Singlecellexperiment |
进口 | 总结性特征,,,,S4VECTORS,,,,生物基因,,,,实验室 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,AnnotationHub,,,,AnnotationDbi,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Biocfilecache,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Batchelor,,,,簇发酵,,,,我明白,,,,评分,,,,scfeaturefilter,,,,烤饼,,,,斯克兰,,,,Singlecellexperiment,,,,Singlecelltk,,,,辛格,,,,总结,,,,Zinbwave |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | scrnaseq_2.0.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scrnaseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/scrnaseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scrnaseq/ |
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