scrnaseq

doi:10.18129/b9.bioc.scrnaseq

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅scrnaseq

公共单细胞RNA-seq数据集的收集

生物导体版本:3.10

基因级计数用于集合的公共SCRNA-seq数据集,该数据集以细胞和基因级元数据为单一的对象提供。

作者:Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Michael Cole [AUT],Aaron Lun [CTB]

维护者:davide risso

引用(从r内,输入引用(“ scrnaseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scrnaseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ scrnaseq”)

html R脚本 用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据,,,,Singlecelldata
版本 2.0.2
执照 CC0
依靠 Singlecellexperiment
进口 总结性特征,,,,S4VECTORS,,,,生物基因,,,,实验室
链接
建议 生物使用,,,,AnnotationHub,,,,AnnotationDbi,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Biocfilecache,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Batchelor,,,,簇发酵,,,,我明白,,,,评分,,,,scfeaturefilter,,,,烤饼,,,,斯克兰,,,,Singlecellexperiment,,,,Singlecelltk,,,,辛格,,,,总结,,,,Zinbwave
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scrnaseq_2.0.2.2.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scrnaseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scrnaseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scrnaseq/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网