mtbls2

DOI:10.18129 / B9.bioc.mtbls2

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mtbls2。

MetaboLights MTBLS2:比较LC / MS-based分析银nitrate-treated野生型拟南芥叶和cyp79B2 cyp79B3双迷人的植物。Bottcher et al。(2004)

Bioconductor版本:3.10

Indole-3-acetaldoxime (IAOx)代表一个早期生物合成的中间各种indolic次生代谢物包括phytoanticipin indol-3-ylmethyl芥子油和植物抗毒素camalexin (3-thiazol-2 -yl-indole)。拟南芥cyp79B2 cyp79B3双基因敲除植物完全受损的转换色氨酸indole-3-acetaldoxime不再积累IAOx-derived代谢物。因此,比较分析野生型和cyp79B2 cyp79B3植物线有可能探索的完整范围IAOx-derived indolic次生代谢物。

作者:史蒂芬诺伊曼< sneumann在ipb-halle.de >

维修工:史蒂芬诺伊曼< sneumann在ipb-halle.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mtbls2”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“mtbls2”)

HTML	R脚本	与xcms MTBLS2处理和分析,MetaboLights相机和出口
HTML	R脚本	与xcms3 MTBLS2处理和分析,MetaboLights相机和出口
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,MassSpectrometryData,RepositoryData
版本	1.16.0
许可证	CC0
取决于	R (> = 2.10)
进口
链接
建议	xcms(> = 3.0.0),相机,Risa(> = 1.0.0),knitr,Heatplus,pcaMethods,sp
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS2https://github.com/sneumann/mtbls2
取决于我
进口我
建议我	自动调谐,首次公开募股,山药
我的链接
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	mtbls2_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mtbls2
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mtbls2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mtbls2/
包下载报告	下载数据