leeBamViews

DOI:10.18129 / B9.bioc.leeBamViews

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅leeBamViews。

leeBamViews——摘自李2009多个酵母RNAseq样本

Bioconductor版本:3.10

数据从PMID 19096707;原型用于管理多个门店样本

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“leeBamViews”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“leeBamViews”)

PDF	R脚本	管理多个门店与bamViews样本
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,RNASeqData,SNPData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData
版本	1.22.0
许可证	艺术2.0
取决于	R (> = 2.15.0),Biobase,Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome
进口	GenomicRanges,GenomicAlignments、方法
链接
建议	GenomeGraphs,biomaRt,org.Sc.sgd.db,刨边机