chipenrich.data

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipenrich.data

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见chipenrich.data．

陪伴包到chipenrich

Bioconductor版本:3.10

支持数据为chippenrich包。包括预先定义的基因集，基因位点定义和可映射性估计。

作者:Ryan P. Welch [aut, cph]， Chee Lee [aut]， Raymond G. Cavalcante [aut, cre]， Laura J. Scott [ths]， Maureen A. Sartor [ths]

维护者:Raymond G. Cavalcante

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("chipenrich.data")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“chipenrich.data”)

超文本标记语言	R脚本	chipenrich.data
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，表观遗传学，ExperimentData，FunctionalGenomics，GeneSetEnrichment，HistoneModification，回归
版本	2.10.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	AnnotationDbi，BiocGenerics、方法、GenomicRanges，GenomeInfoDb，IRanges，readr，rtracklayer，S4Vectors,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，devtools，knitr，rmarkdown，roxygen2，testthat，GO.db，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene，TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm6.ensGene，TxDb.Drerio.UCSC.danRer10.refGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene，TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene，TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGene，TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.refGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	chipenrich
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	chipenrich.data_2.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipenrich.data
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chipenrich.data
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich.data/
软件包下载报告	下载数据