chipenrich.data

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipenrich.data

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见chipenrich.data

陪伴包到chipenrich

Bioconductor版本:3.10

支持数据为chippenrich包。包括预先定义的基因集,基因位点定义和可映射性估计。

作者:Ryan P. Welch [aut, cph], Chee Lee [aut], Raymond G. Cavalcante [aut, cre], Laura J. Scott [ths], Maureen A. Sartor [ths]

维护者:Raymond G. Cavalcante

引文(从R内,输入引用(“chipenrich.data”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("chipenrich.data")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“chipenrich.data”)

超文本标记语言 R脚本 chipenrich.data
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq表观遗传学ExperimentDataFunctionalGenomicsGeneSetEnrichmentHistoneModification回归
版本 2.10.0
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.4.0)
进口 AnnotationDbiBiocGenerics、方法、GenomicRangesGenomeInfoDbIRangesreadrrtracklayerS4Vectors,跑龙套
链接
建议 BiocStyledevtoolsknitrrmarkdownroxygen2testthatGO.dborg.Dm.eg.dborg.Dr.eg.dborg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Rn.eg.dbTxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGeneTxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm6.ensGeneTxDb.Drerio.UCSC.danRer10.refGeneTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneTxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGeneTxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGeneTxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGeneTxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGeneTxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGeneTxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.refGene
SystemRequirements
增强了
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进口我 chipenrich
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 chipenrich.data_2.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipenrich.data
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chipenrich.data
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich.data/
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