RegParallel

DOI:10.18129 / B9.bioc.RegParallel

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RegParallel。

标准回归函数在R支持并行处理大型数据帧

Bioconductor版本:3.10

在许多分析,大量的变量必须是独立测试感兴趣的特征/端点,并调整为协变量和混杂因素在同一时间。这些是主要瓶颈所花费的时间完成这些分析。RegParallel,大量的测试可以同时被执行。144年新款高能效型opteron系统变量可以同时测试,与1000年代的变量处理在几秒钟内通过“嵌套”并行处理。适用于逻辑回归、线性回归条件逻辑回归,Cox比例风险和生存模型,贝叶斯逻辑回归和负二项回归。

作者:凯文Blighe

维护人员:凯文Blighe <凯文在clinicalbioinformatics.co.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RegParallel”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	标准回归函数在R支持并行处理大型数据帧
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文本		新闻

细节

biocViews	DiseaseModel,ExperimentData
版本	1.4.0
许可证	GPL-3
取决于	doParallel,foreach平行,迭代器,data.table,stringr,生存,手臂,质量统计,跑龙套的方法
进口
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr,DESeq2,气道,magrittr,Biobase,GEOquery,biomaRt,survminer
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kevinblighe/RegParallel
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RegParallel_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RegParallel
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RegParallel
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RegParallel/
包下载报告	下载数据