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RTCGA.mutations
DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.mutations
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RTCGA.mutations。
突变的癌症基因组数据集Atlas项目
Bioconductor版本:3.10
包提供突变数据集从癌症基因组图谱项目的所有群组类型http://gdac.broadinstitute.org/。突变数据格式解释这里https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/Mutation +注释+ +(加)+格式规范。与病人的条形码有额外的一列。2015-11-01的数据快照。
作者:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >
维修工:戈辛斯<一下。辛斯gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“RTCGA.mutations”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RTCGA.mutations”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RTCGA.mutations”)
| HTML | R脚本 | 使用RTCGA下载突变数据包含在RTCGA.mutations |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释数据,ExperimentData |
| 版本 | 20151101.16.0 |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.2.0),RTCGA |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | RTCGA |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RTCGA.mutations_20151101.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.mutations |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RTCGA.mutations |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.mutations/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
