这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NestLink。
Bioconductor版本:3.10
提供了下一代测序(上天)和质谱(MS)样本数据,用于开发NestLink代码片段和复制材料。NestLink方法是一种蛋白质粘合剂选择和识别技术能够生物物理描述成千上万的库成员一旦没有处理单个克隆在任何阶段的过程。数据获得在门店和女士平台在功能基因组学中心苏黎世。
作者:帕斯卡Egloff (aut)伊万,齐默尔曼(施),费边·m·阿诺德(施),塞德里克A.J. Hutter(施),Lennart Opitz (aut),露西Poveda(施),Hans-Anton Keserue[所有],基督教Panse (aut (cre),贝恩德•Roschitzki (aut),马库斯·西格(aut)
维护人员:基督教Panse < cp在fgcz.ethz.ch >
从内部引用(R,回车引用(“NestLink”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NestLink”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“NestLink”)
HTML | R脚本 | 0。模拟flycode属性。 |
HTML | R脚本 | 1。高质量链接flycode挥动过滤和nanobody序列。 |
HTML | R脚本 | 2。使用ESP和中心预测分析flycode检测能力 |
HTML | R脚本 | 3所示。比较预测和观察flycodes使用F255744疏水性的价值观。 |
HTML | R脚本 | 4所示。控制实验通过flycodes评估蛋白质检测的鲁棒性(NMETH-A35040增刊。1)指出。 |
HTML | R脚本 | 5。使数据 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,MassSpectrometryData,ReproducibleResearch,SequencingData |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | GPL |
取决于 | R (> = 3.6),AnnotationHub(> = 2.15.3),ExperimentHub(> = 0.99.6),Biostrings(> = 2.51.1),gplots(> = 3.0.0),protViz(> = 0.4.0),ShortRead(> = 1.41.0) |
进口 | grDevices、图形数据,跑龙套 |
链接 | |
建议 | BiocStyle(> = 2.2.0),DT,ggplot2,knitr,rmarkdown,testthat,specL,晶格,尺度 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | NestLink_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NestLink |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NestLink |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NestLink/ |
包下载报告 | 下载数据 |