此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见LungCancerLines.
Bioconductor版本:3.10
读自两个肺癌细胞系:H1993 (met)和H2073 (primary)之间的RNA-seq实验。读取被存储为Fastq文件,用于与gmapR包中的TP53Genome对象一起使用。
作者:科里·巴尔,迈克尔·劳伦斯
维护者:Cory Barr < Barr。科里:gene.com >
引用(从R中,输入引用(“LungCancerLines”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("LungCancerLines")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | CancerData,ExperimentData,基因组,LungCancerData,RNASeqData |
版本 | 0.24.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | Rsamtools |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | gmapR,HTSeqGenie,VariantTools |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | LungCancerLines_0.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LungCancerLines |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LungCancerLines |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LungCancerLines/ |
包下载报告 | 下载数据 |