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JctSeqData
DOI:10.18129 / B9.bioc.JctSeqData
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅JctSeqData。
示例使用JunctionSeq结数数据
Bioconductor版本:3.10
结数数据从数据集从一个例子的一个子集RNA-seq读取从六个样品。数据子样品和修改提供边界情况测试和减少文件大小。
作者:斯蒂芬·哈特利(aut (cre)(博士)
维修工:斯蒂芬·哈特利< JunctionSeq-contact在list.nih.gov >
从内部引用(R,回车引用(“JctSeqData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“JctSeqData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“JctSeqData”)
| 例子介绍 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | ExperimentData,地理,基因组,RNASeqData,Rattus_norvegicus_Data,RepositoryData |
| 版本 | 1.16.0 |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocStyle,DESeq2,DEXSeq,刨边机,JunctionSeq |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://hartleys.github.io/JunctionSeq/ |
| BugReports | http://github.com/hartleys/JunctionSeq/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | JunctionSeq |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | JctSeqData_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/JctSeqData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ JctSeqData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/JctSeqData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
