JASPAR2016

DOI:10.18129 / B9.bioc.JASPAR2016

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅JASPAR2016。

2016年JASPAR数据包

Bioconductor版本:3.10

2016年JASPAR数据包。搜索这个数据库,请使用包TFBSTools (> = 1.8.1)。

作者:通用电气Tan <通用电气。在imperial.ac.uk tan09 >

维护人员:通用电气Tan <通用电气。在imperial.ac.uk tan09 >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“JASPAR2016”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,GeneRegulation,MotifAnnotation
版本	1.14.0
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 3.2.2)方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://jaspar.genereg.net/
取决于我
进口我	esATAC
建议我	CAGEWorkflow,chromVAR,TFBSTools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	JASPAR2016_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/JASPAR2016
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ JASPAR2016
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/JASPAR2016/
包下载报告	下载数据