ihwpaper
doi：10.18129/b9.bioc.ihwpaper
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅ihwpaper。
在IHW纸中复制数字
生物导体版本：3.10
该软件包便利地包装了在IHW纸中重现数字所需的所有功能（https://www.nature.com/articles/articles/nmeth.3885）和根据http://arxiv.orgs/1701.05179提供的最新ARXIV Preprint。因此，它是生物导体IHW软件包的配套软件包。
作者：Nikos Ignatiadis [AUT，CRE]
维护者：nikos ignatiadis
引用（从r内，输入引用（“ ihwpaper”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ihwpaper”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ihwpaper”）
| html | R脚本 | NMETH纸：解释TDR |
| html | R脚本 | NMETH纸：IHW-Bonferroni模拟 |
| html | R脚本 | NMETH纸：真实的数据示例 |
| html | R脚本 | NMETH纸：模拟图 |
| html | R脚本 | NMETH纸：分层直方图 |
| html | R脚本 | 统计文件：IHW-Benjamini-Yekutieli的HQTL分析 |
| html | R脚本 | 统计论文：IHW审查和楼层模拟 |
| html | R脚本 | 各种：BH解释 /可视化 |
| html | R脚本 | 各种：适用于IHW的Grenander估计器（VS ECDF） |
| html | R脚本 | 各种：实际数据示例：1倍重量功能 |
| html | R脚本 | 各种：TDR和PVALUE排斥区域 |
| html | R脚本 | 各种：权重与独立过滤 |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 实验数据，，，，表达数据，，，，rnaseqdata，，，，reproducibleresearch |
| 版本 | 1.14.0 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3），ihw |
| 进口 | RCPP，统计，细条，方法，utils，deseq2，，，，总结性特征，，，，fdrtool，，，，GeneFilter，，，，QVALUE，，，，生物酶，，，，生物基因，，，，生物比较，，，，dplyr， 网格，GGPLOT2，，，，牛仔图 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 测试，，，，rcolorbrewer，，，，韦桑森，，，，秤，，，，栅格，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，呼吸道，，，，帕西拉，，，，deseq，，，，locfdr，，，，花花公子，，，，GGBIO，，，，LATEX2EXP |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ihwpaper_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ihwpaper |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ihwpaper |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ihwpaper/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
