HarmonizedTCGAData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HarmonizedTCGAData

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HarmonizedTCGAData。

处理协调,TCGA五种选定的癌症类型的数据

Bioconductor版本:3.10

这个包包含五种癌症类型的和谐TCGA数据处理中使用“马天乐Aidong张,集成Multi-omic数据使用关联网络融合(曾帮工)对癌症病人集群”。

作者:马天乐

维修工:马天乐< tianlema buffalo.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HarmonizedTCGAData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HarmonizedTCGAData”)

HTML	R脚本	病人亲和矩阵来自和谐,TCGA数据集
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文本		新闻

细节

biocViews	CancerData,ExperimentData,ReproducibleResearch
版本	1.8.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	ExperimentHub
链接
建议	AnnotationHub,knitr,rmarkdown,igraph,生存,曾帮工统计数据,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HarmonizedTCGAData_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HarmonizedTCGAData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HarmonizedTCGAData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HarmonizedTCGAData/
包下载报告	下载数据