此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅HCADATA。
生物导体版本:3.10
该软件包允许直接访问由人类小组Atlas项目生成的数据集,以在R和Bioconductor中进行进一步处理,以舒适的Singlecellexpermiment对象的舒适格式(以其他格式提供:http://preview.data.humancellatlas.orgg/)。
作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE]
维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini
引用(从r内,输入引用(“ hcadata”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hcadata”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Hcadata”)
html | R脚本 | 访问人类细胞图集数据集 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,rnaseqdata,,,,Singlecelldata |
版本 | 1.2.0 |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | r(> = 3.6),Singlecellexperiment |
进口 | 实验室,,,,AnnotationHub,,,,HDF5Array,UTILS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,斯克兰(> = 1.11.4),生物兴奋,,,,评分,,,,Igraph,,,,我明白,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | hcadata_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hcadata |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/hcadata |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hcadata/ |
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