此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅geuvadistranscriptexpr。
生物导体版本:3.10
为Geuvadis项目的CEU个体,Lappalainen等人提供了与染色体19相对应的转录本表达和双期基因型。
作者:Malgorzata Nowicka [AUT,CRE]
维护者:malgorzata nowicka
引用(从r内,输入引用(“ geuvadistranscriptexpr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ geuvadistranscriptexpr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ geuvadistranscriptexpr”)
R脚本 | 从Geuvadis Project进行SQTL分析的转录本表达和基因型的预处理和制备 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验数据,,,,表达数据,,,,基因组,,,,homo_sapiens_data,,,,rnaseqdata,,,,SNPDATA,,,,序列数据 |
版本 | 1.14.0 |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | r(> = 3.3.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 林玛,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,rsamtools,,,,变体, 工具,生物使用,,,,尼特,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Drimseq |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | geuvadistranscriptexpr_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geuvadistranscriptexpr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/geuvadistranscriptexpr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/geuvadistranscriptexpr/ |
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