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CopyhelpeR
DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyhelpeR
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CopyhelpeR。
Helper文件文案
Bioconductor版本:3.10
这个包包含helper文件运行Bioconductor所需包装文案。它包含预1 kb本GC-content及mappability文件参考基因组hg18 hg19, hg38, mm9 mm10。此外,它包含一个黑名单过滤去除区域显示CNV。文件存储为农庄对象从GenomicRanges Bioconductor包。
作者:托马斯Kuilman
维护人员:奥斯卡Krijgsman < o.krijgsman在nki.nl >
从内部引用(R,回车引用(“CopyhelpeR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CopyhelpeR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CopyhelpeR”)
| R脚本 | CopyhelpeR | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExperimentData,GenomicSequence,Homo_sapiens |
| 版本 | 1.18.0 |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.10) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 文案 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CopyhelpeR_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyhelpeR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CopyhelpeR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CopyhelpeR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
