CLLmethylation

DOI:10.18129 / B9.bioc.CLLmethylation

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CLLmethylation．

PACE项目主要CLL样品甲基化数据

Bioconductor版本:3.10

该软件包包括原发血癌百科全书(PACE)项目中包括的原发性慢性淋巴细胞白血病样本的DNA甲基化数据。450万个DNA甲基化阵列的原始数据存储在欧洲基因组-表型组档案(EGA)中，登录号为EGAS0000100174。有关本项目的更多信息，请参阅Dietrich S, Oles M, Lu J等，J. clinin的论文“基于药物扰动的血癌分层”。投资。(2018)和R/Bioconductor软件包BloodCancerMultiOmics2017。

作者:Malgorzata Oles, Andreas Mock

维护者:Malgorzata Oles ，安德烈亚斯Mock <安德烈亚斯。嘲笑embl.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CLLmethylation")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CLLmethylation”)

超文本标记语言	R脚本	CLLmethylation
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CancerData，DiseaseModel，ExperimentData，LeukemiaCancerData
版本	1.6.1
许可证	LGPL
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	SummarizedExperiment，ExperimentHub
链接
建议	BiocStyle，ggplot2，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CLLmethylation_1.6.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CLLmethylation
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CLLmethylation
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CLLmethylation/
软件包下载报告	下载数据