TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

TxDb对象的注释包

Bioconductor版本:3.10

通过将UCSC生成的注释数据库公开为TxDb对象来公开

作者:Marc Carlson, Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor .org> [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensTxDb
版本 3.2.2
许可证 艺术- 2.0
取决于 GenomicFeatures(> = 1.21.30)
进口 AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 注释嵌合体FDb.InfiniumMethylation.hg19FunciSNPHomo.sapiens变体火神
进口我 阿尔卑斯山脉appreci8RChIPQCChIPseekerdecompTumor2Sig希尔达profileplyrRareVariantVisrCGH
建议我 AllelicImbalanceAnnotationDbiannotatrATACseqQCbeadarrayBiocOncoTKBiocParallelbiomvRCNSbiovizBaseBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19bumphuntercgdv17chipenrich.dataChIPpeakAnnochromPlotcpvSNPCRISPRseekderfinderderfinderPlotesATACGA4GHclientGA4GHshinygeneAttribution《创世纪》GenomicAlignmentsGenomicFeaturesGenomicRangesGenomicScoresGenVisRggbiogmapRgQTLstatsgroHMMGUIDEseqHTSeqGenieInPASkaryoploteR桅杆methyAnalysisMutationalPatterns先驱者PureCNR3CPETregionReportRiboProfilingrtracklayerSGSeqSigFugeSplicingGraphsSummarizedExperimentTCGAutilsTFEA。芯片trackViewertranscriptRtximportVariantAnnotationVariantFiltering
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包档案

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源包 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene_3.2.2.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene/
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