snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38

doi:10.18129/b9.bioc.snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38

HOMO SAPIENS的SNP位置(DBSNP Build 141)

生物导体版本:3.10

从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因141.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2014年5月1日创建的,并包含用于参考Genome GRCH38的SNP。请注意,这些SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38或bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38中。重要说明:此软件包已弃用。请根据最新的DBSNP构建使用SNPLOCS数据包(例如,构建144或构建149)。您可以调用R从R中调用BSGENOME :: opic.snps()以获取可用的SNPLOCS数据软件包的列表。

作者:Herve页面

维护者:H。页面>

引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,snplocs
版本 0.99.11
执照 艺术2.0
依靠 r(> = 2.10),S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME(> = 1.33.9)
进口 方法,utils,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME
链接
建议 生物弦,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38(> = 1.3.19)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Genotypeeval,,,,xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38_0.99.11.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38/
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