ENCODExplorerData

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENCODExplorerData

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ENCODExplorerData。

一个编译的编码元数据

Bioconductor版本:3.10

这个包允许用户快速访问项目文件元数据编码,给辅助函数查询访问rest api进行编码,编码下载数据并保存在SQLite数据库格式。

作者:查尔斯·乔利Beauparlant (aut),埃里克·弗尔涅(aut (cre) Arnaud所有权(aut)

维修工:埃里克·弗尔涅< Fournier.Eric。2在crchudequebec.ulaval.ca >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ENCODExplorerData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ENCODExplorerData”)

HTML		介绍ENCODExplorerData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData,AnnotationHub,CustomDBSchema,Homo_sapiens,Mus_musculus
版本	0.99.4
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6)
进口	工具,jsonlite,RCurl,tidyr,data.table、方法
链接
建议	AnnotationHub,RUnit,BiocGenerics,knitr,旋度,httr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/ArnaudDroitLab/ENCODExplorerData/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ENCODExplorerData_0.99.4.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ENCODExplorerData/
包下载报告	下载数据