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BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked
DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked。
野猪蒙面基因组全序列(UCSC susScr3版)
Bioconductor版本:3.10
完整的基因组序列野猪(猪)提供的UCSC (susScr3, 2011年8月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Sscrofa.UCSC序列是一样的。susScr3,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。
作者:Bioconductor Dev团队
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | AnnotationData,BSgenome,遗传学,Sus_scrofa |
| 版本 | 1.3.99 |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | BSgenome(> = 1.31.11),BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3 |
| 进口 | BSgenome,BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3 |
| 链接 | |
| 建议 | |
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| 我的链接 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked_1.3.99.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
