此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38。
生物导体版本:3.10
UCSC(HG38,2013年12月)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.hsapiens.hsapiens.ucsc.hg38”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,homo_sapiens |
版本 | 1.4.1 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | BSGENOME(> = 1.35.16) |
进口 | BSGENOME |
链接 | |
建议 | txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38.masked |
进口我 | 分支机构,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38.masked,,,,EventPointer,,,,Primirtss,,,,特雷娜 |
建议我 | BSGENOME,,,,BSSEQ,,,,Busparse,,,,Circrnaprofiler,,,,CNER,,,,Genvisr,,,,PQSFINDER,,,,RCAS,,,,REMP,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp151.grch38,,,,Ularcirc,,,,xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38 |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38_1.4.1.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |