bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38

Homo Sapiens的完整基因组序列(UCSC版本HG38)

生物导体版本:3.10

UCSC(HG38,2013年12月)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列,并存储在生物弦对象中。

作者:生物导体开发团队

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.hsapiens.hsapiens.ucsc.hg38”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,BSGENOME,,,,遗传学,,,,homo_sapiens
版本 1.4.1
执照 艺术2.0
要看 BSGENOME(> = 1.35.16)
进口 BSGENOME
链接
建议 txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL
取决于我 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38.masked
进口我 分支机构,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38.masked,,,,EventPointer,,,,Primirtss,,,,特雷娜
建议我 BSGENOME,,,,BSSEQ,,,,Busparse,,,,Circrnaprofiler,,,,CNER,,,,Genvisr,,,,PQSFINDER,,,,RCAS,,,,REMP,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp151.grch38,,,,Ularcirc,,,,xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38_1.4.1.4.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网