bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked

doi：10.18129/b9.bioc.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked。

Homo Sapiens的完整蒙版基因组序列（UCSC版本HG19）

生物导体版本：3.10

UCSC（HG19，2009年2月）提供的Homo Sapiens（人）的完整基因组序列，并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中的序列相同，除了它们每个序列都在顶部具有4个接下来的掩码：（1）组装间隙的掩码（Agaps mask）（agaps mask），（2）contra内部掩码歧义（Ambmask），（3）RepotMasker（RM Mask）的重复掩码，以及（4）串联重复搜索器（TRF蒙版）的重复掩码。默认情况下，只有agaps和amb掩模是“活动”的。

作者：生物导体开发团队

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bsgenome.hsapiens.hsapiens.ucsc.hg19.masked”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	AnnotationData，，，，BSGENOME，，，，遗传学，，，，homo_sapiens
版本	1.3.99
执照	艺术2.0
要看	BSGENOME（> = 1.31.8），bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
进口	BSGENOME，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
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包装档案

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源包	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11（El Capitan）
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked/
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