BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19．

智人全基因组序列(UCSC版本hg19)

Bioconductor版本:3.10

智人(人类)的完整基因组序列由UCSC提供(hg19, 2009年2月)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . hspiens . ucsc .hg19")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，BSgenome，遗传学，Homo_sapiens
版本	1.4.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.33.5)
进口	BSgenome
链接
建议	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	注释，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，嵌合体，食典委，motifRG，测序，tra利用，变体
进口我	appreci8R，brainflowprobes，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，ChIPComp，circRNAprofiler，decompTumor2Sig，希尔达，MADSEQ，RareVariantVis，美国广播公司，TCGAWorkflow，trena
建议我	AneuFinder，ArrayTV，ATACseqQC，BadRegionFinder，Basic4Cseq，BBCAnalyzer，biovizBase，ChIPpeakAnno，chromVAR，cn，CNVfilteR，CRISPRseek，customProDB，DNAshapeR，esATAC，FDb.FANTOM4.promoters.hg19，FDb.UCSC.snp135common.hg19，FDb.UCSC.snp137common.hg19，gcapc，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，GenomicScores，GenVisR，ggbio，gmapR，GUIDEseq，Gviz，h5vc，InPAS，感兴趣，IsoformSwitchAnalyzeR，karyoploteR，MEDIPS，MinimumDistance，海市蜃楼，motifbreakR，motifmatchr，MutationalPatterns，ORFik，OrganismDbi，PGA，plyranges，qsea，R453Plus1Toolbox，Rariant，REMP，rGADEM，RiboProfiling，Rsamtools，RSVSim，rtracklayer，SGSeq，签名者，SigsPack，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，StructuralVariantAnnotation，VariantAnnotation，wavClusteR，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，YAPSA
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/
软件包下载报告	下载数据