BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked．

牛牛全掩模基因组序列(UCSC版本bosTau6)

Bioconductor版本:3.10

由UCSC (bosTau6, 2009年11月)提供并存储在Biostrings对象中的牛牛全基因组序列。序列与BSgenome.Btaurus.UCSC相同。bosTau6，除了它们每个都在上面有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . btarus . ucsc . bostau6 .mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，BSgenome，Bos_taurus，遗传学
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6
进口	BSgenome，BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	CNVRanger
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked/
软件包下载报告	下载数据