在示例数据集描述的主要装饰图案,样本相关,因为它们可以来自同一个人或同一个组织。每个变量造成的功能显示了相关结构和联合相关结构。图a, b显示了同一个人,样本之间的相关性(a)展示了样本分类基于相关矩阵的聚类和(b)显示了原始顺序。图c, d显示了相同类型的情节除了展示组织的影响。总相关结构从个人和组织相关求和matricies所示,b。这些情节如下所示的代码来生成。

#适合线性混合模型和检查相关结构#一个基因数据(varPartData)形式< -~年龄+(1|个人)+(1|组织)fitList < -fitVarPartModel(geneExpr [1:2)、形式、信息)#关注一个基因适合=fitList [[1]]

1 #图在个人#相关结构基于相似性#重新排序基于聚类的样本plotCorrStructure(健康,“个人”)

图1 # b#使用原始的样本plotCorrStructure(健康,“个人”,重新排序=假)

图1 # c#组织内相关结构基于相似性#重新排序基于聚类的样本plotCorrStructure(健康,“组织”)

图1 # d#使用原始的样本plotCorrStructure(健康,“组织”,重新排序=假)

2 #图#相关结构中基于相似#个人* *组织,重新排序基于聚类的样本plotCorrStructure(适合)

图2 b ##使用原始的样本plotCorrStructure(健康,重新排序=假)