确定{siggenes} | R文档 |
通过单击SAM图中的相应点来获得基因的特定基因信息
find (x, showText = TRUE, getInfo = TRUE, pos = 4, cex = 0.8, add.xy = numeric(2), n.digits = 3, ask = FALSE, ll = FALSE, browse = FALSE, chip= "",…)
x |
SAM对象 |
showText |
逻辑指示基因名称是否应该在识别点附近绘制 |
pos |
数值,指定绘制基因名称的位置。默认是4 (在点的右边)。有关详细信息和其他规格,请参阅文本吗? |
cex |
指定绘制文本的相对大小的数值。详情见?不相上下 |
添加、xy |
长度为2的数值向量。文本被绘制出来add.xy [1] x方向上的单位add.xy [2] 从默认绘制位置开始的y方向单位 |
n.digits |
指定输出中小数位数的整数 |
问 |
逻辑指示在识别下一个点之前是否应该询问用户 |
噢 |
逻辑指示是否将位点链接和基因符号都添加到输出中 |
浏览 |
逻辑指示是否打开所识别点的轨迹链接对应的NCBI网页。忽略了如果你= FALSE |
芯片 |
指定此分析中使用的芯片类型的字符串。忽略了如果你= FALSE ,如果参数数据 在山姆(数据、cl…) 已由ExpressionSet 对象芯片不需要指定 |
> >代码… | 其他选项如上校对于绘制的文本。看到 |
SAM是由Tusher等人(2001)开发的。
! !斯坦福大学正在申请SAM技术的专利。!!!
Holger Schwender,holger.schw@gmx.de
Tusher, v.g., Tibshirani, R.和Chu, G.(2001)。微阵列在电离辐射响应中的显著性分析。PNAS, 98, 5116-5121。
山姆
,SAM-class
,总结