1.7.5版的更改-修复了range构造的62号问题,as_granges()和as_iranges()函数现在正确处理List列-添加了帮助函数来处理range中的名称。看到了吗?详细信息是range -names。1.7.4版本的变化-为range添加了slice(), GroupedRanges -分组的内部已被彻底检查,但不应该有任何用户面临的变化。现在生成分组要快得多。-组信息可以通过dplyr::group_keys()查询- GRangesList可以通过dplyr::group_split()从GroupedGenomicRanges自动获得-组索引可以通过dplyr:: group_indexes()生成1.7.3版更改- shift_downstream()和shift_upstream()现在可以正确处理矢量量的移位。1.7.2版更改-如果x或y没有元数据列,左外连接重叠操作现在可以工作,参见#70 -在没有非重叠范围的情况下,左外连接重叠操作也将正确地工作。-左外连接重叠不再修改seqinfo(见这里)[https://support.bioconductor.org/p/125623/] -补丁左外连接时,x或y是IRanges,充实重叠文档。1.7.1版更改-重新格式化NEWS。1.5.13版的变化——由于tidyr API的变化,plyranges release和devel删除了unnest(),并用expand_ranges()代替。请将此函数的所有使用替换为expand_ranges() 1.3.4版更改-修复bind_ranges,使其保留行名- 1.1.5版更改-允许在调用plyranges函数时调用正确的泛型,而不加载plyranges - 1.1.4版更改-增加tile/window方法-修复文档1.1.3版更改-文档更新1.1.2版更改-加快group_by方法-重构BAM读取实用程序- 0.99.10版更改- refactored set_width out so it's called internally by mutate - along with set_width there are other internal set_ methods - add _within_directed variants for overlaps methods - modified overscope_ranges to be an S3 method, should enable more refactoring in the future Changes in version 0.99.9 //www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/plyranges.html - package passed review and is now on Bioconductor devel branch! - I've been pretty slack with updating the NEWS file but will be more diligent in the future.