版本0.99.4的变化-------------------------- BUG FIXES o使用阈值时的小错误修复。版本0.99.1的变化-------------------------新特性o这是包的提交版本。版本2.0.0的变化------------------------新功能o新flowType使用增强的动态规划算法在c++中实现,允许只搜索表型空间的子集(使非常高维的数据,如CyTOF和单细胞RT-PCR可行),并允许设置多个表达水平。o注意:这个版本对flowType函数的调用方式带来了一些微小但必要的改变,这可能会破坏一些用户的向后兼容性。还要注意,flowType的返回值不再与版本1兼容。RchyOptimyx的x;用户希望使用RchyOptimyx与flowType 2。X应该使用新的改进版本2。RchyOptimyx的x,这实际上更简单,更直观。版本2.0.1的变化------------------------ o切换到使用BH包的Boost库依赖,而不是打包几个MB的源代码。修正了flowMeans可以提供交错分区的错误,导致直接由flowMeans生成的分区与基于这些分区计算的阈值的分区不一致(正如在c++代码中使用的那样)。现在,在运行flowType的结果中返回的Partitions值基于从初始flowMeans分区计算的阈值,并且与CellCounts中存储的结果一致。o为了保持向后兼容性,允许用户指定method='thresholds'为大写或小写。 CHANGES IN VERSION 2.7.0 ------------------------ o Minor bugfix to make partitions matrix come out correctly when more than one threshold is used.