v1.3.3变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性o恒星聚变导入功能:importFusionData o恒星运行功能:starInstallation阿星安装功能:starRun BiocParallel支持功能:阿星进口fusionName supportingReads filterList变化版本就开始- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性使用o Rsubread对准器代替大礼帽。1.3.12版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性o Picard-tools chimara文件夹中可以下载,picardInstallation。o包装器函数validateSamFile使用皮卡德工具来验证山姆/ BAM文件。包装器函数filterSamReads允许阿萨姆和BAM过滤。1.3.15版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性o裂隙填充物Nadalin et al BMC生物信息学是实现为新创验证工具融合断点。1.5.2版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o prettyPrint新功能函数来生成一个表添加分隔文件输出表单fSet对象的列表。o oncofuse注释了。1.7.1上版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性融合由Rsubread生成的数据可以被导入。版本变化1.7.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性融合由fusionCatcher生成的数据可以被导入。1.9.2版本的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -新特性融合由tophat-fusion-post生成的数据可以被导入。 o Star import function was improved. o Annotation of fusion is more robust as it it is clearly linked to specific genomic releases. e.g. h19 uses BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 and TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene