ZFPKM
doi：10.18129/b9.bioc.zfpkm
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅ZFPKM。
一套促进ZFPKM转换的功能
生物导体版本：3.10
在RNA-Seq FPKM数据上执行ZFPKM变换。该算法基于Hart等人的出版物，2013年（PubMed ID 24215113）。参考建议使用ZFPKM> -3选择表达的基因。用编码打开/封闭的染色体数据验证。使用FPKM或TPM可以很好地适用于基因水平数据。对于成绩单级别的数据，似乎无法很好地校准。
作者：Ron Ammar [AUT，CRE]，John Thompson [AUT]
维护者：Ron Ammar
引用（从r内，输入引用（“ ZFPKM”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ zfpkm”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ ZFPKM”）
| html | R脚本 | ZFPKM转换简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 特征提取，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2。5年） |
| 执照 | GPL-3 |文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.4.0） |
| 进口 | 检查员，，，，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，花花公子，，，，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，林玛，，，，EDGER，，，，地球，，，，Stringr，，，，普林特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ronammar/zfpkm/ |
| BugReports | https://github.com/ronammar/zfpkm/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ZFPKM_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ZFPKM_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ZFPKM_1.8.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zfpkm |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/ZFPKM |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/zfpkm/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
