XCMS
doi：10.18129/b9.bioc.xcms
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅XCMS。
LC-MS和GC-MS数据分析
生物导体版本：3.10
色谱分离和单光谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NETCDF，MZXML，MZDATA和MZML文件中导入。预处理数据，用于高通量，未定位的分析物分析。
作者：Colin A. Smith
维护者：Steffen Neumann
引用（从r内，输入引用（“ XCMS”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ xcms”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
BrowseVignettes（“ XCMS”）
| html | R脚本 | 将FTICR-MS数据与XCMS分组 |
| html | R脚本 | 使用XCMS的LC-MS/MS数据分析 |
| html | R脚本 | LCMS数据预处理和XCMS分析 |
| html | R脚本 | XCMS中的新功能和修改的功能 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 免疫学，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，软件 |
| 版本 | 3.8.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 1.6（R-2.1）或更早（> 15年） |
| 执照 | GPL（> = 2） +文件执照 |
| 要看 | R（> = 2.14.0），方法，生物酶，，，，生物比较（> = 1.8.0），MSNBase（> = 2.9.3） |
| 进口 | MZR（> = 2.19.5），生物基因，，，，蛋白质（> = 1.17.2），格子，，，，rcolorbrewer，，，，plyr，，，，拉恩，，，，多检验，，，，MassSpececebeet（> = 1.5.2），S4VECTORS，，，，鲁棒，，，，iranges |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，表情，，，，尼特（> = 1.1.0），法阿科，，，，MSDATA（> = 0.25.1），NCDF4，，，，RGL，，，，微实验，，，，测试，，，，潘德，，，，马格里特，，，，害怕，，，，pheatmap |
| 系统要求 | |
| 增强 | rgraphviz，，，，rmpi，，，，XML |
| URL | https://github.com/sneumann/xcms |
| BugReports | https://github.com/sneumann/xcms/issues/new |
| 取决于我 | 相机，，，，法阿科，，，，弗拉姆，，，，IPO，，，，洛布斯塔斯，，，，变代，，，，metams，，，，NCGTW，，，，profia，，，，pth2O2lipids |
| 进口我 | 相机，，，，集团，，，，Cosmiq，，，，梅特，，，，Risa |
| 建议我 | clumsid，，，，MassSpececebeet，，，，MSDATA，，，，M型，，，，mtbls2，，，，rforpoteomics，，，，rmassbank |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | XCMS_3.8.2.tar.gz |
| Windows二进制 | xcms_3.8.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | xcms_3.8.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/xcms |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/xcms |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/xcms/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
