西瓜

doi：10.18129/b9.bioc.watermelon

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅西瓜。

Illumina 450甲基化阵列归一化和指标

生物导体版本：3.10

15个Beta和3个性能指标的口味，采用甲基菌和MinFi包装生产的物体的方法。

作者：Leonard C Schalkwyk，Ruth Pidsley，Chloe Cy Wong，由Nizar Touleimat，Matthieu Defrance，Andrew Teschendorff，Jovana Maksimovic，Tyler Gorrie-Stone，Louis El Khoury贡献。

维护者：leo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ Waltermelon”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“西瓜”）

PDF	R脚本	\ rpackage {WaterMelon}软件包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，微阵列，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件，，，，两通道
版本	1.30.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（7年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 2.10），生物酶，，，，林玛， 方法，矩阵，，，，甲基菌，，，，Lumi，，，，鹏，，，，Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，，，，Illuminaio
进口	生物酶
链接
建议	rpmm，，，，Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19，，，，光照明甲基甲基化epicmanifest，，，，irlba
系统要求
增强	Minfi
URL
取决于我	Bigmelon，，，，skewr
进口我	冠军
建议我	rnbeads
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Walmelon_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	WALEMELON_1.30.0.ZIP（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	Walmelon_1.30.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/watermelon
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/西瓜
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/watermelon/
软件包下载报告	下载统计