西瓜

doi:10.18129/b9.bioc.watermelon

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅西瓜

Illumina 450甲基化阵列归一化和指标

生物导体版本:3.10

15个Beta和3个性能指标的口味,采用甲基菌和MinFi包装生产的物体的方法。

作者:Leonard C Schalkwyk,Ruth Pidsley,Chloe Cy Wong,由Nizar Touleimat,Matthieu Defrance,Andrew Teschendorff,Jovana Maksimovic,Tyler Gorrie-Stone,Louis El Khoury贡献。

维护者:leo

引用(从r内,输入引用(“西瓜”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ Waltermelon”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“西瓜”)

PDF R脚本 \ rpackage {WaterMelon}软件包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道
版本 1.30.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(7年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 2.10),生物酶,,,,林玛, 方法,矩阵,,,,甲基菌,,,,Lumi,,,,,,,,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,Illuminaio
进口 生物酶
链接
建议 rpmm,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19,,,,光照明甲基甲基化epicmanifest,,,,irlba
系统要求
增强 Minfi
URL
取决于我 Bigmelon,,,,skewr
进口我 冠军
建议我 rnbeads
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Walmelon_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 WALEMELON_1.30.0.ZIP(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Walmelon_1.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/watermelon
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/西瓜
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/watermelon/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网