waddr

doi:10.18129/b9.bioc.waddr

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅waddr

基于2-Wasserstein距离检测差分分布的统计测试

生物导体版本:3.10

该软件包提供了基于2-Wasserstein距离的统计测试,用于检测和表征样本形式给出的两个分布之间的差异。提供了计算2-wasserstein距离和测试差异分布的功能,以及在单细胞RNA测序数据中针对差异表达的专门量身定制的测试。

作者:Roman Schefzik [AUT],Julian Flesch [CRE]

维护者:julian flesch

引用(从r内,输入引用(“ waddr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ waddr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ waddr”)

html R脚本 waddr
html R脚本 Wasserstein_metric
html R脚本 Wasserstein_singlecell
html R脚本 Wasserstein_test
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 差异性,,,,Singlecell,,,,软件,,,,统计信息
版本 1.0.1
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(<6个月)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6.0)
进口 RCPP(> = 1.0.1),手臂(> = 1.10-1),Biocfilecache,,,,生物比较,,,,Singlecellexperiment,并行,方法,统计
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 尼特,,,,DevTools,,,,测试,,,,roxygen2,,,,rprojroot,,,,rmarkDown,,,,评分
系统要求
增强
URL https://github.com/goncalves-lab/waddr.git
BugReports https://github.com/goncalves-lab/waddr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 waddr_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 waddr_1.0.1.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) waddr_1.0.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/waddr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/waddr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/waddr/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网