此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅waddr。
生物导体版本:3.10
该软件包提供了基于2-Wasserstein距离的统计测试,用于检测和表征样本形式给出的两个分布之间的差异。提供了计算2-wasserstein距离和测试差异分布的功能,以及在单细胞RNA测序数据中针对差异表达的专门量身定制的测试。
作者:Roman Schefzik [AUT],Julian Flesch [CRE]
维护者:julian flesch
引用(从r内,输入引用(“ waddr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ waddr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ waddr”)
html | R脚本 | waddr |
html | R脚本 | Wasserstein_metric |
html | R脚本 | Wasserstein_singlecell |
html | R脚本 | Wasserstein_test |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,Singlecell,,,,软件,,,,统计信息 |
版本 | 1.0.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(<6个月) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.6.0) |
进口 | RCPP(> = 1.0.1),手臂(> = 1.10-1),Biocfilecache,,,,生物比较,,,,Singlecellexperiment,并行,方法,统计 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo |
建议 | 尼特,,,,DevTools,,,,测试,,,,roxygen2,,,,rprojroot,,,,rmarkDown,,,,评分 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/goncalves-lab/waddr.git |
BugReports | https://github.com/goncalves-lab/waddr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | waddr_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | waddr_1.0.1.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | waddr_1.0.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/waddr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/waddr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/waddr/ |
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