的作用

DOI:10.18129 / B9.bioc.uSORT

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见的作用．

uSORT:用于基因选择的自精炼排序管道

Bioconductor版本:3.10

该包旨在从单细胞RNA-seq数据中揭示内在的细胞进展路径。它包括数据预处理、初步PCA基因选择、初步细胞排序、特征选择、精细细胞排序以及分析后的解释和可视化。

作者:刘麦灿，陈浩，陈金淼

维护人员:Hao Chen

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

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超文本标记语言	R脚本	快速启动
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，DNASeq，GUI，ImmunoOncology，RNASeq，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)， tcltk
进口	igraph，矩阵，RANN，RSpectra，VGAM，gplots平行,plyr、方法、集群，Biobase，fpc，BiocGenerics，单片眼镜， grDevices，图形，统计，utils
链接
建议	knitr，RUnit，testthat，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	uSORT_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	uSORT_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	uSORT_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uSORT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/uSORT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/uSORT/
软件包下载报告	下载数据